Špionážna agentúra IMF má obrovský problém. Práve keď jej eso, Ethan Hunt, vykonávalo tajnú operáciu v Moskve, spáchal ktosi úspešný bombový útok na Kremeľ. Ruskí predstavitelia sú nahnevaní do najvyššej miery a hovoria dokonca o vojnovom akte. A pretože sa všetky nitky zbiehajú práve pri IMF, americký prezident dá pre istotu oficiálne od agentúry ruky preč vyhlásením „Ghost Protocolu“, čím ju odstaví od zdrojov, zázemia, podpory a z jej členov urobí ľudí na odstrel. To rozhodne nie je preháňanie, krátko po tomto byrokratickom údere zomiera násilnou smrťou jej oficiálny šéf (Tom Wilkinson). Ethan Hunt sa pokúsi o nemožné. Spoločne s trojicou verných a odhodlaných kolegov (Simon Pegg, Paula Patton a Jeremy Renner) sa pokúsi nájsť páchateľa útoku a zmyť tak zo seba všetku vinu. Ako už bolo povedané v úvode, táto misia bude skutočne nesplniteľná.