Máme rok 1914. Príbeh začína v kotolni múzea, kde sa mladý vedec, cestovateľ a kotoľník Milo Thatch hrá na odborníka vysvetľujúceho podrobnosti o stratenej riši a pritom sníva o dobrodružnej ceste za objavením Atlantídy. Zo snov ho vytrhne až krásna slečna, ktorá mu oznámi, že sa s ním chce rozprávať priateľ jeho zosnulého dedka, tiež veľkého bádateľa a cestovateľa, milionár Whitemor. Starý pochábel pre neho odkladal denník, ktorého obsahom je kľúč k nájdeniu Atlantídy. Milo sa nestihne ani poriadne spamätať a už je členom niekoľko sto člennej posádky (financovanej starčekom Whitemorom) a pomocou špeciálne dimenzovanej ponorky, sa jeho sen pomaly mení na skutočnosť. Po súboji s obrovskou príšerou je posádka donútená zmeniť dopravné prostriedky a vďaka Milovým jazykovým znalostiam nachádza bránu k hľadanej ríši. Tým čo prežili, sa pred zrakom zjavuje krása potopeného kontinentu a jeho obyvateľov. Milo sa zoznamuje s dcérou kráľa Atlantídy Kidou a členovia posádky postupne odhaľujú svoje pravé charaktery. Zatiaľ čo Milovi ide len o objavenie a preštudovanie stratenej ríše, zbytok posádky plánuje ukoristiť tajomný zdroj energie, ktorý by sa dal výhodne predať Nemcom...